1998年8月，经中国人民银行总行批准，设立武汉市银行电子结算，负责电子联行和同城据交换业务的运营。2014年11月，经中国人民银行武汉分行批准，实现运营。结算为会员制事业单位，具有事业法人资格，注册资金3201万元，由各会员银行单位共同筹集，实行核算，自负盈亏。在业务上，接受中国人民银行武汉分行营业管理部的监督与管理。武汉市银行电子结算内设四个部门，下属成立三家全资子公司，业务涉及软件开发、现金清分与延伸服务、征信延伸服务、贵金属销售、酒店运营等，目前有员工近200人。为逐步实现主营业务企业化运作，2016年3月成立全资子公司武汉金融电子结算有限公司，注册资金1500万元。主要承担武汉市银行电子结算的电子网络结算服务、金融电子结算网络信息系统管理、软件开发运维、技术咨询、银行后台服务及业务流程外包服务等。