安徽医科大学为安徽省属大学，入选中西部高校基础能力建设工程，成为安徽省高等教育振兴计划批“地方特色高水平大学建设”高校，教育部“医生教育培养计划”试点高校。[1] 前身是1926年5月创办于上海的私立东南医学院。1949年底响应中共华东局“面向农村，走向内地”的号召，内迁安徽省，成为安徽省所高等医科院校。1952年改名为安徽医学院。1996年6月经国家教委批准，更名为安徽医科大学。截2014年6月，该校设有22个直属教学机构，5所直属附属医院，6所非直属附属医院。共有在职教职工3733人，在校生共18700余人，其中研究生3160余人，留学生250余人。
截2014年4月，该校设有基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院（安徽省口腔医院）、卫生管理学院、生命科学院学院、护理学院、药学院、人文社会科学学院、国际教育学院、公共基础学院、研究生学院、成人教育学院（继续教育学院）、临床医学院、临床学院（附属医院）、第二临床学院（第二附属医院）、巢湖临床学院（附属巢湖医院）、第四临床学院（第四附属医院）、医学检验系、医学影像系、学系、医学心理学系、医学美容系等直属教学机构。
该校拥有5所直属附属医院（附属医院、第二附属医院、第四附属医院、附属巢湖医院、附属口腔医院——安徽省口腔医院），6所非直属附属医院（附属省立医院、第三附属医院——合肥市人民医院、附属合肥医院——合肥市第二人民医院、附属安庆医院——安庆市立医院、附属六安医院——六安市人民医院、附属宿州医院——宿州市立医院），与合肥市共建附属阜阳医院。