建设创新型国家是我国国家战略的核心。北京大学基础性、综合性、交叉性、国际性的学科体系及长期以来形成的强大优势，铸了超群的知识创新能力，产生了大批原创性科技成果，具有国家自主创新的独特优势。加强产学研合作，把北京大学科教优势转化为现实生产力，服务国家建设，是北大工学院的重要战略任务。为此，北大工学院成立“北京大学工学院工程技术研究院”，以“产学研用”紧密结合为宗旨，以北京大学强大的基础研究实力和综合优势为支撑，以一体化和有机集成为发展战略，致力于产业共性技术、关键性技术和前瞻性技术研发，推动成果转化，实现知识创新、技术创新、产品创新与产业创新的协同创新。
北京大学工学院工程技术研究院的使命是致力于工程科学知识发现和应用，研究技术，培育新兴产业，为创建世界工学院及经济社会发展做出应有贡献。
北京大学工学院工程技术研究院的任务主要包括研究、学院下属各单位产学研课题管理、学院与地方政府和企业共建研究机构的管理。
目前，研究院在北京、南京、包头、杭州、绍兴、厦门等地设立了科研和成果转化基地，初步建成了9个工程技术研究所，并将逐步新建10多个研究所，致力于发展为具创新力的应用技术研究机构。