北京大学医学出版社成立于1989年8月，是级专业出版社，也是教育部直属的大学出版社。前身为北京医科大学、中国协和医科大学联合出版社；1999年3月建社，更名为北京医科大学出版社；2002年 8月经新闻出版总署批准，更名为北京大学医学出版社。出版者前缀为ISBN 7-81034，7-81071及7-81116。现任社长陆银道副研究员，总编辑程伯基教授。
打造医学图书精品，服务人民健康事业。建社18年来，我社始终坚持为社会主义服务，为人民健康服务，为医学教育、科研和医疗卫生服务的办社宗旨，坚持社会效益的原则，共出版医学图书2000余种，发行1800余万册。以“高质量、高品位、高水平、多层次”的品牌理念，成为社会信誉度很高的大学出版社，赢得了作者、读者以及出版界业内的认可。被国家教育部确立为“高校出版社”；曾经三次被国家新闻出版总署评为“全国良好出版社”；三次被国家卫生部评为 “杰出科技著作突出贡献出版社”。70余种图书获部、委以上奖，其中《血管生物学》、《消化系统疾病电子内镜图谱》获“中国图书奖”，《科学战胜非典》获第六届国家图书奖特别奖，《泌尿外科内镜诊断治疗学》获中华出版物（图书）奖，实现了社会效益和经济效益的佳结合。
近年来在陆银道社长的领导下，经过全体员工的艰苦奋斗和不懈追求，从初的小社发展成为初具规模和效益的中型出版社。目前，我社正在进行第二次创业，力图把我社建设成为全国重要的医药卫生类教材出版基地和重要的医学专著、译著出版基地。
诚挚地感谢作者、读者及社会各界对我社的支持和信赖，我社决心在党和国家出版方针指引下，进一步深化改革，为繁荣医学出版事业，增进人民健康作出更大的贡献。