思清源与清华大学、中国科学院、日本东京工业大学等相关院校建立稳定的战略合作关系，技术力量雄厚。在运用新型生物技术进行污水治理、生物酶研究、工业微生物育种方面有独到的研究成果。目前已获得多项关于载体、污水处理设备、新型药剂及微生物育种装置等方面的科研成果，拥有多项专利技术。联合清华大学合作开发的“好氧-厌氧耦合污泥减量废水处理技术”已通过教育部科技成果鉴定，鉴定结果为：具有自主知识产权、污泥减量化效果达到国际水平。通过对技术和专利的集成创新，公司开发出“SSLE型生活污水处理设备”，填补了国内小规模（0.5-50吨/天）污水处理设备领域的市场空白，既满足污水的地处理，还达到小型、低能耗、原位污泥减量化的目标。具有巨大的市场潜力，该项目还获得了2009年度中小企业创新基金的专项支持，并到国家项目。