辉瑞于20世纪80年代初进入中国，1989年，在大连建立辉瑞制药有限公司；1997年，在北京设立管理；2004年，在上海成立辉瑞中国地区总部暨辉瑞投资有限公司，2005年，在上海设立辉瑞中国研发。辉瑞在广州、沈阳、南京、武汉、天津、杭州、成都等国内主要城市均设有办事机构，共有员工1800余人，销售队伍覆盖80多个城市。目前，辉瑞中国已经拥有了4个具有世界水平的生产厂：辉瑞大连工厂、辉瑞苏州工厂、辉瑞无锡抗制药工厂和苏州动物保健品工厂。
北京管理共设有十一个职能部门：总经理办公室、企业事务部、市场部、商务发展部、销售部、医学部、医疗保健业务部、法律部、业务技术部、财务部和人力资源部。