杭州余杭运河综合保护开发建设有限公司是余杭区人民政府、杭州市运河综保委、余杭区塘栖镇人民政府三方共同出资组建的国有公司，注册资金2亿元人民币，公司主要负责京杭运河（余杭段）的综合保护和开发建设工作。