启迪科技园南京园区由清华科技园与南京市江宁经济技术开发区根据清华大学和江苏省南京市“省校合作”、“市校合作”的精神建立，是启迪科技园在江苏省开发建设的第二个园区，项目总投资10亿元人民币，总建筑面积30万平方米，致力于为创业企业孵化、 高新企业研发、创新人才培育、科技成果转化提供发展空间和服务。是孵化企业的基地、转化成果的平台、培养创新创业人才的摇篮。

园区将发挥集群式创新优势，形成持续不断的创新创业能力、辐射发展能力和国际化竞争力，形成以新材料、新能源、装备制造业、动漫、软件及软件外包、生物医药等6大产业为主的研发创新平台和产业基地，努力在南京市江宁开发区新一轮科技创新与产业转型中发挥积极作用，成为长三角地区区域创新与产业升级的示范区。