1999年，李光华出任校长，针对学校当时师资不足，总体水平不高，生源状况不理想，办学条件差的情况，提出了“一个，两个加强”(即以优化课堂教学，提高教学质量为，加强师资队伍建设，加强学校制度建设)的办学思想和指导方针，从此学校走上了改革与创新之路。优化课堂教学，提高教学质量是学校发展的生命线。学校以二期课改和新基础教育为抓手，转变教师观念，规范教学行为。致力转变落后的教学模式，陈旧的教学方法，不合理的教学结构，低效率的课堂教学。在师资队伍建设上，学校通过提要求、重培养、给机会、做调整等形式和途经，优化了干伍和教师队伍。

随着各项制度的建立和完善，莘光学校实现了跨越式发展。办学条件不断改善、教学质量明显提高，各科考试成绩均居全区前列，初中升学考试成绩在全区名列前茅。近年来，先后共有500多人次在国家、市、区级比赛中获奖，学校先后被评为“市中学生行为规范示范校”、“市花园单位”、“市二期课改研究基地”、“市体育工作单位”、“市绿化环境卫生工作单位”、“市学生心理健康辅导实验校”、“市语言文字工作单位”、“上海师范大学外国语学院教学实验基地”、“上海师范大学教师见习基地”、“区文明单位”等，学校在近年区办学水平综合督导评估中连续评为A级。

根据市教育工作会议提出的上海要率先实现教育现代化的目标，学校制订了第二个五年发展规划。在坚持“一个，两个加强”的办学思路基础上，努力形成“追求，崇尚”的莘光特色校园文化，创建学校管理特色和体育、艺术特色，实现“的队伍、的管理、的质量”的目标，把莘光学校建设成闵行区品牌学校。历任校长现任校长：鲍立曾经校长：吴克、李光华