深圳市环境监测站成立于1982年，是深圳市人民政府和深圳市人居环境委员会依法设立的环境监测机构，是具有政府行为的社会公益性事业单位。其业务上受中国环境监测总站和广东省环境保护监测站指导，在全国环保系统四级监测站设置体制中属二级站。